為減輕小琉球旅遊人潮對生態造成的負擔，屏東縣政府在公告島上5處潮間帶劃設為自然人文生態景觀區後，其中杉福、漁埕尾、肚仔坪等3處潮間帶列為保育示範區，除限制管控同時間進入人數外，並自7月1日起收取每名遊客60元海洋保育費，專款將用於維護自然生態資源及復育等，期待觀光及生態並存，永續發展。
小琉球的杉福、漁埕尾、肚仔坪等3處潮間帶列為保育示範區。翻攝屏東縣政府
縣府進一步公告杉福、漁埕尾、肚仔坪等3處潮間帶為保育示範區，規定同一時間進入各潮間帶以300人為限，且僅能行走在規劃的路線上，每年12月1日至隔年3月31日為休養期，禁止所有人進入；4月1日至6月15日為繁殖期，夜間8時至隔日清晨5時也禁止進入，6月16日至11月30日可從事夜間導覽解說，但需以紅光燈進行。7月1日起進入3處潮間帶，每人收取60元的海洋保育費，費用將專款專用於永續經營與維護自然生態資源及環境，包括宣導觀光保育觀念、辦理觀光保育教育解說，或管理人員相關訓練、調查及復育自然生態資源、其他有助於推動自然生態保育工作者等。
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縣府海洋及漁業事務管理所指出，依縣府委託中山大學海洋事務研究所特聘教授張水鍇2023年調查杉福、漁埕尾、肚仔坪潮間帶結果，生物（大型底棲無脊椎動物）密度為2014年的43%，相較於2020年提高12%，雖有穩定回升，但速度緩慢。由於近幾年生態和棲地基礎環境都受到負面衝擊，要恢復過去的水準還有很長的一段路，需要政府持續投資及民間協力，持續加強遊客和業者的管理及教育，生態方面則需持續進行監測與復育。
海洋志工隊進行環境保育。翻攝屏東縣政府
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一路以來用鏡頭紀錄「小琉球海洋志工隊」成軍至今歷程的洪桂蓮說，這幾年已經發現魚群有慢慢回流聚集的好現象，自己本身也在經營民宿，發現許多業者將「潮間帶導覽」含括在套裝行程內，導致產生許多抱持著「加減去看看」的遊客，透過收取保育費，可初步篩選出真正對潮間帶生態保育有興趣的人，才能將美好的環境傳承給後代。
小琉球島上環境因遊客過量影響生態。翻攝屏東縣政府
小琉球自然人文生態觀光協會理事長陳文玉也說，自己在生態保育第一線服務超過10年，近年來觀察島上環境生態因遊客過量已受傷，針對生態敏感地區管控遊客量，依法酌收最低額度的60元觀光保育費，可保護生態敏感地區、提升遊憩品質，遊客又有公共意外險保障，一舉數得。(記者曹家維/屏東報導)